Сдвиг рамки считывания у инфузории
У инфузорий рода Euplotes в последовательности белок-кодирующих генов в большом количестве встречаются стоп-кодоны. Однако если такие кодоны находятся близко к старт-кодону, то происходит сдвиг рамки считывания на один нуклеотид в сторону 3′-конца, и рибосома их не замечает. Синтез нуклеиновых кислот начинается с 5′-конца. Рибосома движется от 5′ к 3′-концу зрелой иРНК. Фрагмент начала гена инфузории имеет следующую последовательность (нижняя цепь матричная, или транскрибируемая):
5′-АЦТТЦАТГТЦАЦААТААТЦГТТЦТ-3′
3′-ТГААГТАЦАГТГТТАТТАГЦААГА-5′
Определите нуклеотидную последовательность фрагмента иРНК, найдите открытую рамку считывания, если известно, что синтез полипептида начинается с аминокислоты метионина. Поясните свой выбор. Определите последовательность образующегося на данной иРНК фрагмента полипептида, поясните ответ. При написании последовательностей нуклеиновых кислот указывайте направление цепи.
Условие как в банке ФИПИ — открыть и сверить
| У инфузорий рода Euplotes в последовательности белок-кодирующих генов в большом количестве встречаются стоп-кодоны. Однако если такие кодоны находятся близко к старт-кодону, то происходит сдвиг рамки считывания на один нуклеотид в сторону 3’ конца, и рибосома их не замечает. Синтез нуклеиновых кислот начинается с 5’ конца. Рибосома движется от 5’ к 3’ концу зрелой иРНК. Фрагмент начала гена инфузории имеет следующую последовательность (нижняя цепь матричная (транскрибируемая)):
5’-АЦТТЦАТГТЦАЦААТААТЦГТТЦТ-3’ 3’-ТГААГТАЦАГТГТТАТТАГЦААГА-5’
Определите нуклеотидную последовательность фрагмента иРНК, найдите открытую рамку считывания, если известно, что синтез полипептида начинается с аминокислоты мет. Поясните свой выбор. Определите последовательность образующегося на данной иРНК фрагмента полипептида, поясните ответ. Для выполнения задания используйте таблицу генетического кода. При написании последовательностей нуклеиновых кислот указывайте направление цепи.
Генетический код (иРНК от 5ʹ к 3ʹ концу)
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Это задание с развёрнутым решением: ответом считается запись хода решения, а не строка. Напишите решение на бумаге и сравните с разбором — там каждый шаг с обоснованием.
Открыть разбор1Мягкая — с чего смотретьуровень 1 из 3
иРНК комплементарна матричной цепи ДНК и совпадает с кодирующей цепью, если в ней заменить тимин на урацил.
2Наводящая — какие числа считатьуровень 2 из 3
Стартовый кодон — $АУГ$. При обычном считывании после него появляется стоп-кодон $УАА$, поэтому нужно учесть сдвиг рамки на один нуклеотид в сторону 3′-конца.
3Прямая — фактически решениеуровень 3 из 3
После сдвига последовательность кодонов имеет вид $АУГ\ УЦА\ ААУ\ ААУ\ ЦГУ\ УЦ$, поэтому фрагмент полипептида начинается как Мет–Сер–Асн–Асн–Арг.